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Haut fonctionnaire, ingénieur général des ponts, des eaux et des forêts de classe exceptionnelle, Docteur en sciences économiques, Joël MATHURIN a commencé sa carrière en tant que chercheur junior à l’Institut national de recherche agronomique de 1992 à 1997.

Chargé d'études à la direction des affaires financières et économiques au ministère de l'Agriculture et de la Pêche (1997-1999), puis chef du bureau de l'orientation économique et de l'environnement des entreprises à la direction des politiques économique et internationale à ce même ministère (1999-2001), il fut ensuite chef du service régional de la protection des végétaux à la direction régionale de l'agriculture et de la forêt de Rhône-Alpes de 2001 à 2005.

Sous-directeur de la qualité et de la protection des végétaux à la direction générale de l'alimentation du ministère de l'Agriculture, de l'Alimentation, de la Pêche et de la Ruralité (2005-2008), puis détaché comme sous-préfet de Roanne (2008-2012), il fut ensuite secrétaire général de la préfecture du Doubs (2012-2014).

Préfet délégué pour l'égalité des chances auprès du préfet de l'Essonne, d'octobre 2014 à novembre 2016, il fut successivement préfet de la Nièvre (2016-2018), préfet du Doubs (2018-2021), puis préfet du Morbihan (2021-2022).

Directeur de cabinet de M. Jean-François CARENCO au ministère délégué chargé des Outre-mer, de juillet 2022 à juillet 2023, et parallèlement directeur adjoint du cabinet de M. Gérald DARMANIN, ministre de l'Intérieur et des Outre-mer, M. Joël MATHURIN était, depuis septembre 2023, préfet du Puy-de-Dôme.

Joël Mathurin est Chevalier de la Légion d’honneur, Chevalier de l’Ordre National du Mérite, Officier du mérite agricole, décoré de la médaille d'honneur de l'engagement ultramarin.