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Alto funzionario, ingegnere generale dei ponti, delle acque e delle foreste di classe eccezionale, dottore in scienze economiche, Joël MATHURIN ha iniziato la sua carriera come ricercatore presso l'Istituto nazionale di ricerca agronomica dal 1992 al 1997.

Direttore di ricerca presso la direzione affari finanziari ed economici del ministero dell'Agricoltura e della Pesca (1997-1999), poi capo dell'ufficio orientamento economico e ambiente delle imprese presso la direzione politiche economiche e internazionali dello stesso ministero (1999-2001), è stato poi capo del servizio regionale per la protezione delle piante presso la direzione regionale dell'agricoltura e delle foreste della regione Rodano-Alpi dal 2001 al 2005.

Vicedirettore della qualità e della protezione delle piante presso la direzione generale dell'alimentazione del ministero dell'Agricoltura, dell'Alimentazione, della Pesca e delle Aree rurali (2005-2008), in seguito distaccato come sottoprefetto di Roanne (2008-2012), è stato poi segretario generale della prefettura del Doubs (2012-2014).

Vicario per le pari opportunità presso il prefetto dell'Essonne, da ottobre 2014 a novembre 2016, è stato successivamente prefetto della Nièvre (2016-2018), prefetto del Doubs (2018-2021) e poi prefetto del Morbihan (2021-2022).

Direttore di gabinetto di Jean-François CARENCO presso il Ministero dell'Oltremare, dal luglio 2022 al luglio 2023, e contemporaneamente vicedirettore di gabinetto di Gérald DARMANIN, Ministro dell'Interno e dell'Oltremare, Joël MATHURIN ha ricoperto, dal settembre 2023, la carica di prefetto del Puy-de-Dôme.

Joël Mathurin è Cavaliere della Legion d'Onore, Cavaliere dell'Ordine Nazionale al Merito, Ufficiale al Merito Agricolo, insignito della medaglia d'onore per l'impegno oltremare.